①分子蒸餾在高真空條件下進行，則設備內要具有較低的殘氣壓力。這要求：
　　
　　a．正確地選擇真空泵組及管道尺寸，以保證足夠快地從容器內抽出氣體。
　　
　　b．正確選擇蒸發面與冷凝面的形狀、距離及相對位置，以保證從設備的蒸餾空間內無阻礙地引出殘余氣體。蒸發面與冷凝面之間的距離過小時，一方面不利于抽除殘氣，另一方面蒸餾液的霧沫也易濺到冷凝面上，從而降低了分離效果。蒸發面與冷凝面的間距都選得比較大，一般為1cm—2cm，甚至有5cm—6cm。
　　
　　c．分子蒸餾多用于分離熱不穩定性物質，故要求被加工物料在蒸餾溫度下停留較短的時間。從表10-110可知，離心式設備內物料停留時間z*短。
　　
　　d．由機理分析可知，液層內部的擴散是影響分子蒸餾過程的重要因素，因而分子蒸餾設備應力求減少液層厚度及強化液層的位移，使之湍動。刷膜式設備內液層攪動z*好。

　　
　　②被蒸餾的液體必須預先除氣。在大氣壓下，任何液體都含有或多或少的氣體，此氣體含量決定于液體本身的性質和它進入蒸餾裝置之前所處的狀態。每升魚肝油中含有0.6—0.8L氣體，在1.31×10^2Pa的壓力下，此氣體的體積為0.45L—0.6×10^6L，可見未經除氣的液體不能直接加入蒸餾釜，否則不能保證系統的真空度。