制藥廢水零排放是根據水資源供給情況作的理想狀態下的方案，其前提條件就是運行產生的廢水經處理后能全部被相關用水區域消化，無直接對廠區外排放的廢水。那么，制藥廢水零排放實施過程中會有什么問題。    產生的廢水難以完全被收集： 1、全廠廢水系統分布范圍廣、涉及專業多，廢水的收集就是一個大問題。特別是鍋爐房零米、除灰除渣系統、輸煤系統等區域面積大，用水的點多且量大。廢水溝道分布是否合理，收集坑的數量是否滿足廢水排放量，是廢水收集的關鍵。如果廢水不能全部收集就必有部分廢水從廠區雨排水井流出，造成對廠區及周邊環境的污染。 2、對于南方電廠而言，地下水位高，地基軟，溝道、水池容易因不均勻沉降發生開裂現象，導致廢水外溢或內滲，污染地下水質。另外灰場在施工時未做好防滲處理也會導致廢水滲漏污染。    廢水能否全部被處理合格： 1、電廠排水要全部回用需進行脫鹽處理，投資大，運行成本高，從經濟角度考慮并不適宜，部分污染物含量少，水質較清的排水如循環冷卻水排水，因排水量較大無法全部回用，環保要求也未將此部分排水定義為工業廢水。此部分排水將通過全廠外排口排出。 2、廢水處理設備的運行效果，出水水質是隨運行時間增加而不斷下降。設備的檢修維護及運行管理不當也會造成出水水質下降，嚴重的話會導致出水水質達不到設計要求。

3、如在生產運行過程中出現，酸堿、油污等大量泄露的緊急事態，應對不當也會造成廢水排放量或雜質含量超出廢水處理設備設計處理能力，而導致廢水未處理合格而回用或排放。