化糞池的清掏周期與糞便污水溫度、氣溫、建筑物性質及排水水質、水量有關。設計清掏周 期過短，則化糞池糞液濃度過高，與實際清掏周期差距過大，影響正常發酵和污水處理效果，甚至造成糞液漫溢，影響環境衛生。
    設計清掏周期過長，則化糞池容積過大，增加造價。《建筑給水排水設計規范》（GBJ15-88）（以下簡稱《規范》）要求清掏周期為3～12個月，實際設計中多取3～9個月，而酸性發酵階段的酸性發酵期為3個月，酸性減退期為5個月左右。
    實踐證明：清掏周期的取定，應兼顧污水處理效果、建設造價、管理三個方面因素清掏周期一般不宜少于12 個月。上元門水廠宿舍區平房群共用化糞池，使用人數200人，生活污水標準每人30L/d，污泥量每人0.4L/d，進入化糞池新鮮污泥含水率取95%，發酵后污泥含水率取90%，設計清掏周期選取12個月，經計算化糞池容積為21m3。
化糞池在使用過程中應注意：
　    （一）新池建成確認無滲漏，并養護兩周后正式啟用。
　　（二）使用中要控制用水量。
　　（三）及時清理糞皮和糞渣，在糞池內取出的糞渣須經堆肥法或化學法處理后再作肥料，第三池取出的糞水可直接用作肥料。
　　（四）保持化糞池蓋板的密封性，在清渣或取糞水時，不得在池邊點燈、吸煙等，以防發酵產生的沼氣遇火爆炸。