城市專項規(guī)劃需要建立在水生態(tài)、水環(huán)境、水安全、水資源等方面規(guī)劃完善的基礎(chǔ)上，編制工作非常復(fù)雜，廣東省城鄉(xiāng)規(guī)劃設(shè)計研究院規(guī)劃師趙崇標在《關(guān)于城市規(guī)劃的新認識》的報告中提出，難度主要表現(xiàn)在理念、技術(shù)、體制等幾個方面：
一、理念方面。在規(guī)劃編制時要求從工程導(dǎo)向向問題導(dǎo)向轉(zhuǎn)變，要注意系統(tǒng)性，綜合考慮源頭、過程、末端的有機整合，不能將城市專項規(guī)劃變成單純的低影響開發(fā)規(guī)劃、指標分解規(guī)劃。
二、技術(shù)方面。城市專項規(guī)劃的編制需要模型、監(jiān)測評估技術(shù)的輔助；而這些新技術(shù)的應(yīng)用水平在我國目前普遍還不高。
三、體制方面。城市建設(shè)涉及到規(guī)劃、城建、園林、建筑、水利、市政等多個專業(yè)，需要多主管部門的協(xié)調(diào)配合；導(dǎo)則規(guī)劃方案是多部門的博弈和協(xié)調(diào)的結(jié)果。
其中，編制或修改控制性詳細規(guī)劃時，應(yīng)參考城市專項規(guī)劃中確定的雨水年徑流總量控制率等要求，并根據(jù)實際情況，落實雨水年徑流總量控制率等指標。編制或修改城市道路、綠地、水系統(tǒng)、排水防澇等專項規(guī)劃，應(yīng)與城市專項規(guī)劃充分銜接。
城市建設(shè)涉及水生態(tài)、水環(huán)境、水安全、水資源甚至水文化各個方面；相比傳統(tǒng)的工程規(guī)劃，城市規(guī)劃關(guān)注的是通過城市規(guī)劃建設(shè)管控系統(tǒng)解決城市水問題的方案，而非單一型的市政設(shè)施建設(shè)，其理念和要求需要專項規(guī)劃統(tǒng)籌，從而在城市建筑與小區(qū)、道路與廣場、公園與綠地等各要素中落實并有機銜接，相互配合，系統(tǒng)實現(xiàn)。